MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 10120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009943	TTTTA	2	10	7	16	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009943	CT	3	6	1453	1458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009943	TTC	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009943	T	6	6	1492	1497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009943	T	6	6	1499	1504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009943	T	6	6	1514	1519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009943	AATTT	2	10	1520	1529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009943	ACC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009943	CT	3	6	4017	4022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009943	A	7	7	4057	4063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009943	ACC	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009943	CTT	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009943	AAAAAC	2	12	7263	7274	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009943	CCT	2	6	7741	7746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009943	GGC	2	6	7754	7759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009943	TCG	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009943	GCG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009943	ACA	2	6	7813	7818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009943	CTC	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009943	GC	3	6	7843	7848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009943	GCC	2	6	7872	7877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009943	T	6	6	7927	7932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009943	AC	3	6	9233	9238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009943	CCT	2	6	9778	9783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009943	ATA	2	6	9789	9794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009943	AAATCG	2	12	9881	9892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009943	ATCGGG	2	12	9901	9912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009943	CAA	2	6	9932	9937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009943	TTC	2	6	9945	9950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009943	TTC	2	6	9962	9967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009943	GAA	2	6	10043	10048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009943	G	6	6	10057	10062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009943	CGC	2	6	10083	10088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009943	ATCGGG	2	12	10095	10106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009943	TTC	2	6	10156	10161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009943	CAA	3	9	10264	10272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009943	A	8	8	10271	10278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009943	T	7	7	10303	10309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009943	T	6	6	10346	10351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009943	TCC	2	6	11681	11686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009943	CTTGTG	2	12	11724	11735	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009943	GAT	2	6	11738	11743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009943	C	7	7	11776	11782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_009943	CCG	2	6	11835	11840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009943	TAAA	2	8	11880	11887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009943	TGT	2	6	11917	11922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009943	TCT	2	6	11954	11959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009943	TGGA	2	8	11983	11990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009943	AAAATT	2	12	13719	13730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009943	T	6	6	16784	16789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009943	CGA	2	6	16812	16817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009943	GGC	2	6	16875	16880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009943	CGC	2	6	16903	16908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009943	CCCG	2	8	17007	17014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_009943	A	6	6	17069	17074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009943	GCG	2	6	17727	17732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009943	GC	3	6	17764	17769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009943	CTTGAA	2	12	17770	17781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009943	TCCAG	2	10	17855	17864	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009943	TGG	2	6	17873	17878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009943	CTGA	2	8	17907	17914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009943	TGT	2	6	17923	17928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009943	CGC	2	6	17930	17935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009943	ATGG	2	8	17984	17991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009943	TCC	2	6	18594	18599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009943	T	8	8	18608	18615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009943	CG	3	6	18622	18627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009943	GC	3	6	18646	18651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009943	GTTAT	2	10	18655	18664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009943	AAAC	2	8	18760	18767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009943	A	6	6	24309	24314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009943	CGGC	2	8	24330	24337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009943	CGGGAT	2	12	24359	24370	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009943	AGGGCC	2	12	24394	24405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009943	CTG	2	6	24503	24508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009943	CCGG	2	8	24550	24557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009943	GCG	2	6	24586	24591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009943	AAG	2	6	24601	24606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009943	TTC	2	6	24682	24687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009943	GGC	2	6	24695	24700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009943	GCC	2	6	24744	24749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009943	ATT	2	6	24786	24791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009943	A	6	6	24836	24841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009943	GCG	2	6	25005	25010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009943	CCGATA	2	12	25054	25065	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009943	CAG	3	9	27166	27174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009943	TCCT	2	8	28549	28556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009943	CGG	2	6	28615	28620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009943	CGC	2	6	28629	28634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009943	CGGC	2	8	28641	28648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009943	T	9	9	28679	28687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009943	A	7	7	28691	28697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009943	A	6	6	28763	28768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009943	TAA	2	6	28774	28779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009943	AGG	2	6	28788	28793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009943	TCT	2	6	29579	29584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009943	CCG	2	6	36124	36129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009943	CGGC	2	8	36143	36150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009943	GTT	2	6	36163	36168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009943	T	6	6	38715	38720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009943	CGCA	2	8	38760	38767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009943	TCG	2	6	41165	41170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009943	CTG	3	9	41173	41181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009943	GTTTT	2	10	42710	42719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009943	CCGGC	2	10	42750	42759	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_009943	A	8	8	42784	42791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009943	TAGTA	2	10	42792	42801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009943	GCG	2	6	42803	42808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009943	GCC	2	6	42855	42860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009943	TAA	2	6	42911	42916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009943	CAAC	2	8	42921	42928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009943	GTT	2	6	42941	42946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009943	AGG	2	6	42955	42960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009943	ACC	2	6	43846	43851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009943	TAA	2	6	43881	43886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009943	GGA	2	6	43892	43897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009943	CCCCTG	2	12	46001	46012	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009943	ATA	2	6	46086	46091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009943	AGG	2	6	46092	46097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009943	AGC	2	6	46099	46104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009943	CCT	2	6	46105	46110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009943	TTA	2	6	46119	46124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009943	T	6	6	49010	49015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009943	TC	3	6	50561	50566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009943	GGC	2	6	50572	50577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009943	CGG	2	6	51411	51416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009943	GAA	2	6	51423	51428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009943	GGC	2	6	51436	51441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009943	CTC	2	6	51442	51447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009943	ATA	2	6	51450	51455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009943	GTG	2	6	51511	51516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009943	ACA	2	6	51612	51617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009943	CGG	2	6	51619	51624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009943	CA	3	6	51678	51683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009943	CTGA	2	8	54142	54149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009943	TGT	2	6	54158	54163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009943	CGC	2	6	54165	54170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009943	ATGG	2	8	54219	54226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009943	CAT	2	6	54238	54243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009943	CGGT	2	8	54697	54704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009943	TGA	2	6	54736	54741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009943	GGT	2	6	54760	54765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009943	AC	3	6	54792	54797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009943	CGGTG	2	10	54808	54817	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009943	AAC	2	6	55060	55065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009943	AT	3	6	55160	55165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009943	CGATAC	3	18	56298	56315	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_009943	AAT	2	6	59247	59252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_009943	CTT	2	6	63364	63369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009943	TGT	2	6	63404	63409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_009943	AAC	2	6	63412	63417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_009943	AGG	2	6	63424	63429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009943	GCGA	2	8	71347	71354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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279	NC_009943	T	7	7	102812	102818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_009943	A	6	6	102948	102953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009943	TTA	2	6	102968	102973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009943	T	8	8	102984	102991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009943	TCA	2	6	103020	103025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_009943	GGC	2	6	103029	103034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_009943	TTTA	2	8	103053	103060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009943	TA	3	6	107992	107997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_009943	GAG	2	6	162793	162798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_009943	CGA	2	6	162804	162809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_009943	GCTTC	2	10	162845	162854	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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439	NC_009943	CAG	2	6	166898	166903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_009943	TCGA	2	8	169228	169235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
442	NC_009943	TAA	2	6	169253	169258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_009943	CAC	2	6	169380	169385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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447	NC_009943	CGAC	2	8	169412	169419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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453	NC_009943	T	7	7	169579	169585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_009943	ACC	2	6	175011	175016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_009943	TCC	2	6	175028	175033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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465	NC_009943	T	6	6	175115	175120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_009943	AGG	2	6	175165	175170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_009943	T	6	6	175734	175739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_009943	A	6	6	175765	175770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_009943	GGC	2	6	175789	175794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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474	NC_009943	T	7	7	182011	182017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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